Uma vez estruturada a Faculdade de Medicina da Santa Casa, tornou-se natural que seu primeiro Diretor fosse o Doutor Emilio.

Então, ser Diretor da Faculdade era, ao mesmo tempo, ser Diretor do Curso de Medicina; e assim o Doutor Emilio o foi por três mandatos (de três anos cada um: de 1963 a 1972). Então assumiu o Pediatra Doutor Jacob Renato Woiski, que dirigiu a Faculdade e o Curso por um único mandato (de 1973 a 1975). Em 1975 foi nomeado o Clínico Cardiologista Doutor Adauto Barbosa Lima (que comandou a Faculdade por) dois mandatos (de 1976 a 1981), período de grandes atribulações sociais no país, que viveu os referidos como “Anos de Chumbo” [foi época em que dois alunos que se afastaram da atividade acadêmica e passaram a agir contra o Governo de então, e acabaram sendo mortos: Chael Charles Schreier, e Hiroaki Torigoe]. Em seus mandatos, o Doutor Adauto teve incisiva participação de seu Vice-Diretor, o Patologista Doutor José Donato de Próspero. De 1982 a 1984 o Diretor (insisto, da FACULDADE e de seu Curso de Medicina) foi o anatomista Professor Doutor Orlando Jorge Aidar (que aos 20 de Maio de 1963 ministrara a primeira aula aos primeiros “calouros”); seu Vice foi o ortopedista Doutor Waldemar de Carvalho Pinto, que em 1985 foi nomeado Diretor.

Circunstancialmente, o Provedor da Irmandade, Doutor Mario Altenfelder, convidou o Doutor Carvalho Pinto para substituí-lo; aceitando o convite, e antes de terminar seu segundo mandato, este se afastou da Diretoria (em 1989), assumindo seu vice, o Professor Orlando Jorge Aidar, que terminou o período de Direção. Em 1990 assumiu o Psiquiatra Doutor Stanislau Krynski, que por doença se afastou do cargo em 1992.

A Fundação resolveu nomear um Diretor-Tampão, no caso o cirurgião Doutor João Fava. Este, ao assumir (em 1993), solicitou com insistência, e foi atendido pela Mantenedora, que seu Vice fosse um ex-aluno da FACULDADE, no que foi atendido: o Doutor Fava convidou para tal cargo e ex-aluno da segunda turma (graduado em 1969), o Doutor Ernani Geraldo Rolin. Pela primeira vez, na história da Escola Médica, um ex-aluno dela chegava a tal posto. Pois dois mandatos, o Doutor Fava comandou os destinos da Faculdade e de seu Curso de Medicina.

Terminado o mandato (em 1999), o Doutor Ernani foi nomeado o novo Diretor (insisto: foi o primeiro ex-aluno da Escola Médica a chegar ao seu posto acadêmico de maior relevância).

O Professor Ernani, desde o início de seu mandato tinha o propósito de justificar o que rezava o título da escola: FACULDADE DE CIÊNCIAS MÉDICAS DA SANTA CASA DE MISERICÓRDIA DA SANTA CASA DE SÃO PAULO.

Como “CIÊNCIAS MÉDICAS”, assim no plural, se apresentava um único curso: o da Ciência da Medicina?

E logo estabeleceu comissões encarregadas de formatar mais cursos superiores. Dessas comissões, lograram êxito as que propuseram os cursos de Enfermagem e de Fonoaudiologia (que submetidos à avaliação do MEC receberam aprovação com nota máxima, não só pela excelência da estrutura didática, como das instalações de trabalhos, como do corpo docente. O curso de Enfermagem iniciou suas atividades em 2001, e o de Fonoaudiologia iniciou suas atividades em 2002).

Agora a Faculdade contava com três Cursos e, obviamente cada um tendo seu Diretor.

Por decisão do Colegiado Acadêmico maior, a Congregação, estabeleceu, em 2005, que a Faculdade teria um Diretor Geral, e cada curso o seu Diretor particular.

Como Diretor da FACULDADE seria mantido o Professor Ernani Geraldo Rolin, iniciando aí seu mantado como tal (seu Vice foi o ortopedista José Soares Hungria Neto, e lembro que seu pai o fora, também, vice do Doutor Athié).

Para o Curso de Medicina nomeou-se, em 2005, o Ortopedista Doutor Osmar Pedro Arbix de Camargo, da primeira turma, graduado em 1968.

Para o Curso de Enfermagem foi nomeada a Enfermeira Doutora Maria do Carmo Querido Avelar.

Para o Curso de Fonoaudiologia foi nomeada a Fonoaudióloga Doutora Kátia de Almeida.

Restringindo esta histórico ao Curso de Medicina, o Professor Osmar foi substituído pelo cirurgião Doutor Luiz Arnaldo Szutan em 2008, ex-aluno da Oitava Turma, graduado em 1975.

Por sua vez, o Doutor Szutan foi substituído pelo otorrinolaringologista Professor Doutor José Eduardo Lutaif Dolci em 2011, ex-aluno da Décima Primeira Turma, (graduado em 1978).

Na ocasião da nomeação do Doutor Dolci ocorreu também o encerramento do mandato do Professor Ernani, que foi substituído pelo igualmente ex-aluno, membro da quarta turma e graduado em 1971, o clínico Doutor Valdir Golin que ocupou o cargo por dois mandatos a partir de 2012, auxiliado pelo seu vice (e colega de turma, o clínico Osmar Monte).

Em 2017, terminado seu segundo período como Diretor, o Doutor Valdir foi substituído pelo Sanitarista Doutor Paulo Carrara de Castro que, ao assumir, nomeou o ex-aluno [da Décima Quarta turma (graduado em 1981)], o cirurgião Doutor Carlos Alberto Malheiros para ser o Diretor do Curso de Medicina.